学部参与建设地表过程与资源生态国家重点实验室和遥感科学国家重点实验室2个国家级科研平台,建有环境演变与自然灾害教育部重点实验室、环境遥感与数字城市北京市重点实验室、中药资源保护与利用北京市重点实验室3个省部级重点实验室和1个黑龙江九三土壤侵蚀教育部野外科学观测研究站,建有防沙治沙教育部工程研究中心、天然药物教育部工程研究中心、北京市陆表遥感数据产品工程技术研究中心和北京市防沙治沙工程技术中心4个省部级工程技术研究平台。
学部面向国家重大需求,瞄准国际前沿科学问题,积极承担国家各类重大科学研究任务。近五年承担国家和地方各类科研项目800余项,主持国家重点研发计划、第二次青藏科考项目、第三次新疆科考项目、国家自然科学基金重大重点项目等国家各类重大科学研究任务80余项,年均科研经费超1亿元。在国内外学术期刊上发表论文3200余篇,其中SCI/SSCI论文2100余篇,核心期刊论文900余篇;出版学术著作80部,其中专著60部,编著、译著、地图集等20部;获得国外专利6项,国内发明专利171项,实用新型专利44项,软件著作权273项;获得科技奖励64项,其中省部级奖励45项。